Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc33Q3ULW6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms