Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Parp8Q3UD82 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms