Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf166Q3U9F6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf166Q3U9F6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms