Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Rnf180Q3U827 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Rnf180Q3U827 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rnf180Q3U827 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
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Rnf180Q3U827 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Rnf180Q3U827 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf180Q3U827 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Rnf180Q3U827 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Rnf180Q3U827 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf180Q3U827 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf180Q3U827 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf180Q3U827 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf180Q3U827 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Rnf180Q3U827 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf180Q3U827 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf180Q3U827 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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