Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrn4clQ3TYX2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lrrn4clQ3TYX2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms