Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf6Q3TWW8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms