Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TchpQ3TVW5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TchpQ3TVW5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms