Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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