Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem38aQ3TMP8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem38aQ3TMP8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms