Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf3c3Q3TMP1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms