Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xlr4cQ3TKR2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xlr4cQ3TKR2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms