Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Treml4Q3LRV9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Treml4Q3LRV9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms