Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms