Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vax1Q2NKI2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax1Q2NKI2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms