Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rpusd3Q14AI6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpusd3Q14AI6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpusd3Q14AI6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpusd3Q14AI6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd3Q14AI6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rpusd3Q14AI6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rpusd3Q14AI6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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