Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf3ip1Q149C2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms