Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Spatc1Q148B6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Spatc1Q148B6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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