Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NeblQ0II04 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms