Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms