Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm3Q08189 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm3Q08189 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms