Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fmn1Q05860 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Fmn1Q05860 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fmn1Q05860 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms