Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col10a1Q05306 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col10a1Q05306 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms