Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rcn1Q05186 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms