Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sox8Q04886 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms