Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msx2Q03358 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms