Protein–RNA interactions for Protein: Q03141

Mark3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark3Q03141 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mark3Q03141 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mark3Q03141 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mark3Q03141 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mark3Q03141 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mark3Q03141 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mark3Q03141 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms