Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb4Q02738 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms