Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba1Q02053 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba1Q02053 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba1Q02053 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba1Q02053 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba1Q02053 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba1Q02053 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba1Q02053 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba1Q02053 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba1Q02053 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Uba1Q02053 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uba1Q02053 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms