Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VcpQ01853 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VcpQ01853 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VcpQ01853 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms