Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Top2aQ01320 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Top2aQ01320 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Top2aQ01320 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms