Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms