Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms