Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AlkP97793 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AlkP97793 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlkP97793 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlkP97793 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlkP97793 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlkP97793 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlkP97793 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlkP97793 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlkP97793 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AlkP97793 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlkP97793 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlkP97793 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlkP97793 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlkP97793 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlkP97793 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlkP97793 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlkP97793 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AlkP97793 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlkP97793 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AlkP97793 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AlkP97793 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlkP97793 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AlkP97793 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms