Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bop1P97452 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms