Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vgll3P85442 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vgll3P85442 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms