Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms