Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgfbiP82198 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms