Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb2P81069 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb2P81069 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms