Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx3P81067 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms