Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr1bP70700 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms