Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9xP70398 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9xP70398 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms