Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp3P70281 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms