Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf6P70279 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf6P70279 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms