Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrig1P70193 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrig1P70193 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms