Protein–RNA interactions for Protein: P70172

Slc10a2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a2P70172 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc10a2P70172 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc10a2P70172 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms