Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc9P70170 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc9P70170 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc9P70170 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms