Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrkcbP68404 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcbP68404 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms