Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tuba4aP68368 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba4aP68368 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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