Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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