Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps3P62908 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms